巢湖市第一人民医院成立于1952年，其前身系皖南军区陆军医院和安徽省军区野战医院合并而成，定名为“安徽省第四康复医院”，院址在肥西县。1954年3月，迁至巢县。1959年，更名为“安徽省立巢湖医院”，隶属省卫生厅。1969年，巢湖行署成立后，医院下放巢湖地区，更名为“巢湖地区医院”。2000年，巢湖撤地设市，医院更名为现名“巢湖市第一人民医院”。经过近六十年的建设和发展，已成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等功能为一体的综合性医院。2006年3月被评为三级甲等医院。2011年3月，被安徽医科大学批准为非直属附属医院，又名安徽医科大学附属巢湖医院。