睾酮是男性分泌的其中一种雄激素，而睾酮是促进男性阴经正常发育的最重要因素。但是，睾酮的产生需要几个部位的共同作用，分别是下丘脑、垂体、性腺轴，这三个部位产生的激素共同影响着睾酮的分泌。

1、低促性腺激素性腺功能低下症：由下丘脑和垂体发育异常引发的一系列脑组织异常情况，导致促性腺激素分泌不足而出现小阴茎。

2、高促性腺激素性腺功能低下症：因为睾丸发育不全出现促性腺激素受体缺陷、雄激素合成或代谢障碍等情况，从而引发小阴茎。