中国人民解放军309医院成立于1958年，2004年5月并入中国人民解放军总医院，对内称中国人民解放军解放军总医院第三〇九临床部，对外称中国人民解放军解放军总医院第二附属医院。2009年8月更名为解放军总参谋部总医院。