男性非淋菌性尿道炎症状比淋病轻，尿道有刺痒感或灼热感，偶有刺痛感，尿道口有分泌物，但较淋病的分泌物稀薄，为清稀状或淡黄色，分泌物量也较淋病少。在长时间未排尿或晨起首次排尿前才逸出少量分泌物，有时仅表现为裤裆污染，有时病人无任何自觉症状。

但男性非淋菌性尿道炎会伴随多种并发症

1、前列腺炎：急性期排尿有较剧烈的疼痛感，并向尿道、阴囊和臀部方向放射。直肠有坠胀。也可合并排尿困难和阴茎痛性勃起，少数伴有发热或全身不适。直肠指检有前列腺肿大和压痛。尿中可出现透明丝状物或灰白色块状物。多数患者开始时即为慢性表现，表现为排尿不适、有会阴部、腹股沟、耻骨联合上部、腰背部的轻微疼痛或酸胀感。检查时前列腺呈不对称肿大、变硬或硬结。

2、附睾炎：可分急性和慢性。急性非淋菌性附睾炎较少见，发生率为1%，常与尿道炎症同时存在，多为单侧性。表现为附睾肿大，变硬，输精管增粗、触痛，也可有阴囊水肿。慢性期时，附睾尾部可有硬结和精索增粗。常可因性生活过度和酗酒等诱因引起急性发作。附皋炎时血清抗体有明显增高，因此，血清学检查对附睾炎的诊断有较大意义。

3、精囊精索炎：常与前列腺同时存在。其临床表现与前列腺炎相似，同时有精液带血、射精痛和遗精次数增多等症状。直肠指检可发现前列腺上界两侧压痛、肿胀或有条束状物。