光动力疗法作为一种全新的疾病治疗手段，其治疗费用的高低问题一直有争议。原因是由于国内省份的经济条件和发展速度不同，医院的收费标准不同，从而导致光动力疗法治疗费用出现高低不同的情况。以艾拉-光动力治疗尖锐湿疣或皮肤癌为例，的光敏剂艾拉(盐酸氨酮戊酸118mg/支)药房零售价750元/支，执行的是全国最低零售价。治愈率达到98%，复发率只有10.33%。而传统的治疗方法，如激光，电离子，注射干扰素，虽然可见疣体烧灼后迅速消除，但无法清除HPV亚临床感染和潜伏病灶，造成治疗不彻底，过了几周到几个月又会复发，整体的复发率会超过40%或更高。而且目前的情况是，临床医生在使用激光和电离子治疗的同时，还要使用多种全身和局部药物进行治疗，药品又占据了很大的一部分医疗费用，不仅整体的治愈时间长，影响病人的日常生活，反复复发3次后，其整体治疗费用也要花~元钱，甚至更多，这还没有算上病人的误工和其他费用。因此，从整体治疗疗程的性价比来说，相对传统的治疗模式，光动力治疗费用并不高。

　　其实，整体治疗疗程性价比高只是光动力疗法的一个方面，高治愈率和低复发率才是光动力疗法最主要的优势，因为光动力疗法是目前唯一一种可以同时治疗尖锐湿疣和HPV亚临床感染的治疗方案，显著降低复发率。而且，传统方法治疗尖锐湿疣，对尿道口、尿道内等特殊部位的疣体大都采用激光烧灼或手术切除，这样肯定会有创伤性，造成尿道粘连，狭窄，对器官的功能也会有很大影响。而光动力疗法是无创的，可以完好地保留原来的组织结构和功能，并且没有传统治疗因创面粘连愈合所造成的尿道狭窄等副作用。